Projekta nosaukums: Augu šūnu kokultivācija kā virzītājspēks baktēriju biosintētisko gēnu klasteru aktivācijai un evolūcijai
Projekta identifikācijas Nr.: lzp-2025/1-0098
Projekta izpildes termiņš: 2026. gada 1. janvāris – 2028. gada 31. decembris
Projekta kopējais finansējums: 300 000,00 EUR
Projekta vadošais partneris: Latvijas Universitāte (projekta vadītāja Anete Borodušķe)
Projekta zinātniskais vadītājs BMC: Dr. biol. Dāvids Fridmanis
Projekta kopsavilkums:
Endofīti ir zināmi ar spēju sintezēt bioaktīvus savienojumus un atdarināt saimniekaugu metabolītus, taču mehānismi, kas šo spēju nosaka, joprojām nav skaidri. Šajā projektā tiek pētīts, vai baktēriju un augu šūnu suspensiju kokultivācija var sniegt eksperimentālu ieskatu ķīmiskās mimikrijas mehānismos un atklāt līdz šim neizmantotu baktēriju biosintētisko potenciālu. Projekta mērķis ir izpētīt augu un baktēriju kokultivāciju kā rīku baktēriju biosintētiskās kapacitātes paplašināšanai.
Darba uzdevumi:
- S. coelicolor promotoru–reportieru bibliotēkas izveide, lai noteiktu produktīvākos kokultivācijas apstākļus;
- adaptīvās laboratorijas evolūcijas eksperimentu veikšana, lai novērtētu mutāciju biežumu un dabu S. coelicolor genomā kokultivācijā ar augu šūnām;
- neaktīvo vai mazaktīvo biosintētisko gēnu klasteru aktivācija, izmantojot transkriptomikas un nemērķētas metabolomikas pieejas.
Šis pētījums sniegs jaunas fundamentālas zināšanas par endofītu–augu ķīmiskās mijiedarbības pamatmehānismiem un veicinās mikroorganismu resursu pārprofilēšanu pielietojumiem bioaktīvu vielu ieguvē.
Informācija publicēta 05.01.2026.
Projekta progress:
- gada 1. janvāris – 2026. gada 31. marts
Pārskata periodā (1.ceturksnī) veikts darbs pie sekojošiem uzdevumiem:
1) veikta bibliotēkas veidošanai izmantojamās plazmīdas pavairošana, izdalīšana un sekvencēšana.
2) uzsākts darbs pie biosintētisko gēnu atlases priekš bibliotēkas veidošanas, balstoties uz literatūras datiem – izvērtējot publiski pieejamos datus par gēnu ekspresiju un regulācijas mehānismiem.
3) veikta S.coelicolor kultivācija dažādās barotnēs, biomsas iegūšanai LC-MS metodikas optimizācijai.
4) projekts popularizēts pasākumā Universs LU 2026, dodot iespēju apmeklētājiem apskatīt S.coelicolor un S.nigra šūnu kultūras.
Informācija publicēta 31.03.2026.